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JASPAR matrix models:
ID name species class family Sequence logo
MA0020.1  Dof2  Zea mays   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0021.1  Dof3  Zea mays   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0034.1  Gam1  Hordeum vulgare   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0044.1  HMG-1  Pisum sativum   High-mobility group (HMG) domain factors  - 
MA0045.1  HMG-I/Y  Pisum sativum   High-mobility group (HMG) domain factors  - 
MA0053.1  MNB1A  Zea mays   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0054.1  myb.Ph3  Petunia x hybrida   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0064.1  PBF  Zea mays   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0082.1  squamosa  Antirrhinum majus   MADS box factors  - 
MA0096.1  bZIP910  Antirrhinum majus   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0097.1  bZIP911  Antirrhinum majus   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0120.1  id1  Zea mays   C2H2 zinc finger factors  - 
MA0121.1  ARR10  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0123.1  abi4  Zea mays   AP2/ERF domain  - 
MA0127.1  PEND  Pisum sativum   -  - 
MA0128.1  EmBP-1  Triticum aestivum   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0129.1  TGA1A  Nicotiana sp.   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0548.1  AGL15  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0549.1  BZR2  Arabidopsis thaliana   -  - 
MA0550.1  BZR1  Arabidopsis thaliana   -  - 
MA0551.1  HY5  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0552.1  PIF1  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0553.1  SMZ  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0554.1  SOC1  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0555.1  SVP  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0556.1  AP3  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0557.1  FHY3  Arabidopsis thaliana   SWIM-type zinc finger  - 
MA0558.1  FLC  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0559.1  PI  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0560.1  PIF3  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0561.1  PIF4  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0562.1  PIF5  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0563.1  SEP3  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0564.1  ABI3  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA0565.1  FUS3  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA0566.1  MYC2  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0567.1  ERF1B  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0568.1  MYC3  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0569.1  MYC4  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0570.1  ABF1  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0005.2  AG  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0571.1  ANT  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0008.2  HAT5  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  - 
MA0110.2  ATHB-5  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  - 
MA0573.1  ATHB-9  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  - 
MA0574.1  MYB15  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0575.1  F3A4.140  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0576.1  RAX3  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0577.1  SPL3  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA0578.1  SPL8  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA0579.1  CDC5  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0580.1  DYT1  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0581.1  LEC2  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA0582.1  RAV1  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0583.1  RAV1(var.2)  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0584.1  SEP1  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0001.2  AGL3  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0585.1  AGL1  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0586.1  SPL14  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA0587.1  TCP16  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA0588.1  TGA1  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0589.1  ZAP1  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA0590.1  LFY  Arabidopsis thaliana   -  - 
MA0930.1  ABF3  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0931.1  ABI5  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0932.1  AHL12  Arabidopsis thaliana   A.T hook factors  HMGA factors 
MA0933.1  AHL20  Arabidopsis thaliana   A.T hook factors  HMGA factors 
MA0934.1  AHL25  Arabidopsis thaliana   A.T hook factors  HMGA factors 
MA0935.1  NAC025  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA0936.1  T11I18.17  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA0937.1  NAC055  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA0938.1  NAC058  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA0939.1  NAC080  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA0940.1  AP1  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA0941.1  ABF2  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0942.1  ARF1  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA0943.1  ARF5  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA0944.1  ARF8  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA0945.1  ARR1  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0946.1  ARR11  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0947.1  ARR14  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0948.1  ARR18  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0949.1  ARR2  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0950.1  ATHB-12  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA0951.1  ATHB-16  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA0952.1  ATHB-51  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA0953.1  ATHB-6  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA0954.1  ATHB-7  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA0955.1  POPTR_0002s00440g  Populus trichocarpa   SBP-type zinc finger  - 
MA0956.1  BEE2  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0957.1  BHLH3  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0958.1  BHLH13  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0959.1  AIB  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0960.1  BHLH104  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0961.1  BHLH112  Oryza sativa Japonica Group   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0962.1  BHLH34  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0963.1  BHLH78  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0964.1  BIM1  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0965.1  BIM2  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0966.1  BIM3  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0967.1  BZIP60  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0968.1  bZIP68  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA0969.1  CMTA2  Arabidopsis thaliana   CG-1 domain  - 
MA0970.1  CMTA3  Arabidopsis thaliana   CG-1 domain  - 
MA0971.1  DREB1A  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0972.1  CCA1  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA0973.1  CDF2  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0974.1  CDF3  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0975.1  CRF2  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0976.1  CRF4  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0977.1  DOF2.5  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0978.1  DREB1E  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0979.1  ERF008  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0980.1  RAP2-10  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0981.1  DOF1.8  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0982.1  DOF2.4  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0983.1  DOF5.6  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0984.1  DOF5.7  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0985.1  DRE1C  Arabidopsis thaliana   Beta-Hairpin-Ribbon  AP2 MBD_like 
MA0986.1  DREB2C  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0987.1  PHYPADRAFT_140773  Physcomitrella patens   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0988.1  PHYPADRAFT_143875  Physcomitrella patens   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA0989.1  PHYPADRAFT_153324  Physcomitrella patens   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA0990.1  EDT1  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA0992.1  ERF4  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0993.1  ERF7  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0994.1  ERF8  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0995.1  ERF039  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0996.1  ERF043  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0997.1  ERF069  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0998.1  ERF096  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA0999.1  ERF098  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1000.1  ERF105  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1001.1  ERF11  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1002.1  ERF112  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1004.1  ERF13  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1005.1  ERF3  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1006.1  ERF6  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1007.1  PHYPADRAFT_173530  Physcomitrella patens   AP2/ERF domain  - 
MA1008.1  PHYPADRAFT_182268  Physcomitrella patens   AP2/ERF domain  - 
MA1009.1  ARF3  Arabidopsis thaliana   B3 domain  - 
MA1010.1  PHYPADRAFT_64121  Physcomitrella patens   AP2/ERF domain  - 
MA1011.1  PHYPADRAFT_72483  Physcomitrella patens   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA1012.1  AGL27  Arabidopsis thaliana   MADS box factors  - 
MA1013.1  GATA10  Arabidopsis thaliana   Other C4 zinc finger-type factors  GATA-type zinc fingers 
MA1014.1  GATA11  Arabidopsis thaliana   Other C4 zinc finger-type factors  GATA-type zinc fingers 
MA1015.1  GATA12  Arabidopsis thaliana   Other C4 zinc finger-type factors  GATA-type zinc fingers 
MA1016.1  GATA15  Arabidopsis thaliana   Other C4 zinc finger-type factors  GATA-type zinc fingers 
MA1017.1  GATA8  Arabidopsis thaliana   Other C4 zinc finger-type factors  GATA-type zinc fingers 
MA1018.1  GATA9  Arabidopsis thaliana   Other C4 zinc finger-type factors  GATA-type zinc fingers 
MA1019.1  Glyma19g26560.1  Glycine max   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1020.1  GT-1  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1021.1  PHYPADRAFT_48267  Physcomitrella patens   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA1022.1  PHYPADRAFT_38837  Physcomitrella patens   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA1023.1  PHYPADRAFT_28324  Physcomitrella patens   AP2/ERF domain  - 
MA1024.1  HAT1  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA1025.1  HBI1  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA1026.1  ATHB-15  Arabidopsis thaliana   Homeo domain factors  HD-ZIP factors 
MA1027.1  KAN1  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1028.1  KAN4  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1030.1  P0510F09.23  Oryza sativa Japonica Group   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1031.1  OJ1581_H09.2  Oryza sativa Japonica Group   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1032.1  DREB1G  Oryza sativa Japonica Group   AP2/ERF domain  - 
MA1033.1  OJ1058_F05.8  Oryza sativa Japonica Group   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA1034.1  Os05g0497200  Oryza sativa Japonica Group   AP2/ERF domain  - 
MA1035.1  TCP4  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1036.1  MYB111  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1037.1  MYB24  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1038.1  MYB3  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1039.1  MYB4  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1040.1  MYB46  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1041.1  MYB55  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1042.1  MYB59  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1043.1  NAC083  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA1044.1  NAC92  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA1045.1  NAC043  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA1046.1  NTL9  Arabidopsis thaliana   NAC/NAM  - 
MA1047.1  TGA5  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA1048.1  ERF018  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1049.1  ERF094  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1050.1  OsI_08196  Oryza sativa Indica Group   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1051.1  RAP2-3  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1052.1  RAP2-6  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1053.1  ERF109  Arabidopsis thaliana   AP2/ERF domain  - 
MA1054.1  ARALYDRAFT_897773  Arabidopsis lyrata subsp. lyrata   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1055.1  SPL1  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA1056.1  SPL11  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA1057.1  SPL12  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA1058.1  SPL4  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA1059.1  SPL5  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA1060.1  SPL7  Arabidopsis thaliana   SBP-type zinc finger  - 
MA1061.1  SPT  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA1062.1  TCP15  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1063.1  TCP19  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1064.1  TCP2  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1065.1  TCP20  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1066.1  TCP23  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1067.1  TCP5  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1068.1  TGA2  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA1069.1  TGA6  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA1070.1  TGA7  Arabidopsis thaliana   Basic leucine zipper factors (bZIP)  - 
MA1071.1  DOF5.3  Arabidopsis thaliana   C2H2 zinc finger factors  Dof-type 
MA1073.1  TRB2  Arabidopsis thaliana   Tryptophan cluster factors  Myb/SANT domain factors 
MA1074.1  UNE10  Arabidopsis thaliana   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  - 
MA1075.1  WRKY12  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1076.1  WRKY15  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1077.1  WRKY18  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1078.1  WRKY2  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1079.1  WRKY21  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1080.1  WRKY23  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1081.1  WRKY25  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1083.1  WRKY30  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1084.1  WRKY38  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1085.1  WRKY40  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1086.1  WRKY43  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1087.1  WRKY45  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1088.1  WRKY48  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1089.1  WRKY57  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1090.1  WRKY60  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1091.1  WRKY62  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1092.1  WRKY63  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1093.1  WRKY75  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1094.1  WRKY8  Arabidopsis thaliana   WRKY  - 
MA1095.1  ARALYDRAFT_495258  Arabidopsis lyrata subsp. lyrata   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1096.1  ARALYDRAFT_496250  Arabidopsis lyrata subsp. lyrata   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1097.1  ARALYDRAFT_493022  Arabidopsis lyrata subsp. lyrata   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
MA1098.1  ARALYDRAFT_484486  Arabidopsis lyrata subsp. lyrata   Basic helix-loop-helix factors (bHLH)  TCP domain 
 
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